Гъбата Alternaria carthami причинява листно петно при влажни, дъждовни условия, което възпрепятства покълването на семената на шафран и предизвиква гниене на разсадите. По листата се появяват кафяви петна с диаметър около 1,3 см. Първоначално те се образуват в долната част на растението и с напредване на вегетационния период се изкачват нагоре, засягайки и листните листове на цветовете и главичките със семена. Това може да доведе до цялостно изсъхнали, оцветени семена, безполезни за птици или за добив на масло.
Американските селекционери започнаха в началото на 60‑те години на 20‑вото вековие в Сидни, Монтана, работа по хибридни сортове шафран, устойчиви на Алтернария. Резултатът беше няколко устойчиви култивари, сред които най-известен е \"Girard\" (Carthamus tinctorius), въведен в късните 80‑те години и все още се отглежда с добри добиви.
Според Утехският университет за разширяване на познанията, следните сортове показват различни нива на устойчивост или толерантност към Алтернария:
Въпреки че съществуват сортове, които са устойчиви или толерантни към Алтернария, никой от тях не дава 100 % гаранция. На пазара се предлагат сертификатни семена, свободни от болести, както и семена, обработени с препарати за предпазване от Алтернария.