Органичните стандарти изискват от производителите да избягват синтетични пестициди при борба с вредителите. Културните методи често намаляват или предотвратяват проблемите при ябълките, но понякога е необходима и спрей‑обработка. В Съединените щати органичните регулации позволяват употребата на определени нискотоксични химикали, без да се застрашава сертификатът. Тези продукти могат да се използват и от домашни градинари за постигане на по‑добри добиви.
Мед
- Медните съединения, като меден сулфат (блустоуне) и Бордо смес, са ефективни срещу повечето гъбични заболявания на ябълките. Те се задържат дълго върху листата, което намалява нуждата от повторни спрейове. Препоръчва се да не се използват големи количества и да се избягва пръскане при студено и влажно време, тъй като това увеличава риска от увреждане на растението.
Сяр
- Сярните препарати, включително известковия сяр, се борят с мъховете, листните бради и други гъби, както и с някои насекоми. Препаратите имат характерен мирис на гнил яйца и могат да бъдат корозивни при наличие на известка. Не се препоръчва употреба при температури над 27 °C. Сярът убива полезните насекоми и паяци, затова се прилага само когато другите методи се провалят. По‑евтино решение е микрофинот сяр.
Микроби
- Някои бактерии, вируси и гъби се използват за контрол на насекоми. Примери: Bacillus thuringiensis (контролира гъсеници), Beauveria bassiana (вреди на кълци, трипсове, aphids) и грануловирус, атакуващ ябълковия кобил. Тези продукти не остават остатъци, но могат да засегнат и нецелеви видове.
Течности от зеленчуци
- Екстракти от чесън и лют пипер се използват за отблъскване на животни и някои насекоми. Според Cornell University те не са много ефективни срещу основните вредители на ябълките, но могат да дърпат птици, елени и други животни. Токсичността е ниска, но изисква редовно приложение на концентрирани разтвори.
Глина
- Нанасянето на каолинова глина създава бяла, неатрактивна покривка, която пречи на храненето и размножаването на насекоми. Глината е доста евтина и е нетоксична – се използва и като хранителна добавка. Ефективна е срещу plum circulio, по‑малки ябълкови червеи, ябълковия кобил и различни листни ролери. Не е отровна за пчелите, но многократната употреба може да навреди на някои полезни видове. След прибиране на реколтата глината изисква обилно почистване.
Растителни токсини
- Неем (Azadirachta indica) произвежда съединения, токсични за насекоми, но безопасни за хора и животни при правилна употреба. Неемовото масло контролира aphids, leafhoppers и някои листни миньори, но е по‑мало ефективно срещу кълци, щитовки и мухи. То е отровно за пчелите, докато е влажно, и може да замърси водните ресурси. Пиретрин, извлечен от цветето на пиретрума, е активен срещу европейския ябълков сърник, ябълковия червей, aphids, листни кочани и гъсеници. Деградира бързо и изисква чести приложения. Синтетичните пиретрони не се приемат в органичните стандарти, въпреки че произхождат от същото растение.