Един възможен недостатък на устойчиви на хербициди култури е, че тя потенциално може да доведе до животновъдите, използващи големи количества хербициди , за да атакува плевели. Тъй като не съществува риск от унищожаване на посевите с хербициди , земеделските производители не могат да се чувстват необходимостта да бъде разумно за това как те разпространяват хербицида . Повишената употреба на хербициди, носи рискове за околната среда , което може да доведе до увеличаване на замърсяването. Възможни ефекти включват замърсяване на подпочвените води , носещи риск за човешкото здраве. Наем Нови Weeds в
В случай на определени култури , използването на устойчиви на хербициди култури може да се задейства еволюция на нови видове плевели в областта , според Организацията на ООН за прехрана и земеделие . Тези плевели ще бъдат устойчиви на хербициди в употреба и нови хербициди ще трябва да бъдат развити и използвани на засегнатите култури , за да се управлява , устойчива на хербициди плевели . В допълнение , доброволец култури , устойчиви на хербициди може да се появи като щетите .