Посадъчният растения чрез клониране е често много по-скъпо , отколкото производството на растения от семена . Размножаване на растенията чрез резници , наслояване , присаждане и деление изисква повече оборудване , знания и опит от най- засаждане на семена прави , особено когато те се извършват по скалата на маса. Резници, слоеве и присадки обикновено се съхраняват в контролирани условия, за да се гарантира успех , докато те са вкоренени . Tissue култура клониране е сложна процедура, извършена в лаборатория от ботаник . Дори когато изпълнението на тези задачи в дома градината , клонирането е по-скъпо , по-тежка работа и отнема повече време, отколкото засаждане на семена.
Загуба на разнообразие
Клониране пречи на естественото еволюцията на растенията опрашващи и кръстосване с други растения за създаване на нови сортове , което води до загуба на многообразието сред видовете . Естествена еволюция помага за създаване на различни растения, с различни черти и характеристики, като например листа форми, цветове на цветя или размера на растенията. Всички екосистеми естествено имат множество разновидности на едно и също растение в това място . Това позволява елиминирането на този сорт в нещо събитие , като болест или вредители , убива от един щам, който е чувствителен към него, докато друг сорт ще живее , продължаване на растението. Като не позволява еволюцията да се случи , цели щамове на съществуващите инсталации могат да бъдат загубени на места, където се използват само клонирани растения , което води до липса на разнообразие в генетичния фонд .