Размерът на цветята на магнолиите варира, но дори най‑малките са достатъчно големи, за да впечатлят. При видове като жълт поплар и краставично дърво цветята са с диаметър 5‑8 см, докато южната магнолия достига до 30 см. Други видове – Аш, голямолиста, Фрейзър, чашовидна и чадъра – също произвеждат цветя с диаметър 25‑30 см.
Повечето магнолии имат бели или кремави цветове, но съществуват хибриди с по-ярки нюанси. Например сортът „Ann“ показва пурпурно‑червени цветове, а „Betty“ – червено‑пурпурни с бял вътрешен участък. „Yellow Bird“ и „Yellow Lantern“ са магнолии с жълти до кремаво‑жълти цветове.
Големите цветя имат широки, разтворени листа, докато при някои видове с по‑малки цветове се наблюдава чашовидна или камбановидна форма. Жълтият поплар (наричан и „тюлпаново дърво“) има цветове, наподобяващи тюлпани, а краставичното дърво – камбановидни.
Цъфтежът се различава между видовете, но всички цветове се появяват преди края на пролетта. Магнолия „Star“ цъфти още през март, преди листата да се появят. Южната магнолия цъфти през май‑юни и може да продължи да цъфти през лятото след основния период.
Някои магнолии растат толкова високо, че цветята им са трудно достъпни. За ландшафтен дизайн често се предпочитат по‑малки дървета или хибридни храсти. Хибридите „Ann“ и „Betty“ достигат 3‑4,5 м. Същото важи за японската магнолия „Kobus“ и чашовидната магнолия, които рядко надвишават 7,5 м височина.