Бонсайът е древна китайска практика, при която се оформя и подрязва растение до миниатюрна форма. През 13‑вия век дзен будистите предават изкуството на японците, които го усъвършенстват и създават живи произведения, символизиращи хармонията между човека, природата и елементите. Много видове пустинни растения са идеални за бонсай поради бавния си растеж, интересните форми и способността им да издържат в сурови условия.
Пустинен роз (Adenium obesum) – 1,2‑1,5 м височина, произхожда от източна Африка и Арабия. Събира множество 5 см тръбовидни цветове. Краткият му растеж го прави популярен избор за бонсай според Университета във Флорида.
Джадово дърво (Crassula argentea) – сукулент от Южна Африка, често отглеждан като бонсай и домашно растение. През пролет‑лято се нуждае от влажна почва, а през зимата почвата трябва да изсъхне между поливките. Има тъмнозелени до синкаво‑сиви, овални листа, някои сортове – с червени ръбове.
Тексасов ебони (Ebenopsis ebano) – вечнозелено дърво до 12 м, с плътна корона и бавен растеж. Произхожда от Чихуахуанската пустиня в Мексико и южния Тексас. Устойчиво на суша, топлина и студ, често се използва за бонсай.
Западен кедър (Juniperus occidentalis) – вечнозелено иглено дърво от високопустинните райони на Орегон, Калифорния и Айдахо. Има здрав сърцевиден дървес, който варира от кремав до тъмночервено‑кафяв. Този кедър е изключително издръжлив на суша и високи температури.
Атласов фисташ (Pistacia atlantica) – полу‑листопадно до листопадно дърво, част от семейството Anacardiaceae. Произхожда от Северна Африка и Близкия изток, расте бавно до 18 м височина. Често се използва в озеленяването и е интересен избор за пустинен бонсай (университет в Аризона).
Йерусалимски бодил (Parkinsonia aculeata) – декоративно дърво с листопадна листна маса, произхождащо от юго‑западните части на САЩ, Мексико и Южна Америка. Има ароматни жълти цветове и твърда, храстиобразна форма, подходяща за бонсай.
Плодови дървета също се използват за бонсай. Много сортове се адаптират към пустинни условия и продължават да носят плодове. При пример, ябълките Anna, Golden Dorsett и Ein Shemer се отглеждат успешно в пустинята на Аризона. Смокинята, с сортове като Black Mission, White Kadota и Brown Turkey, също се представя добре. Сливовите сортове Santa Rosa, Gulf Ruby и Gulf Gold издържат на сухия климат.